Der Träger der Freien Christlichen Schulen Bonn/Rhein-Sieg e.V. wurde 2009 gegründet. Er entstand aus einer Elterninitiative und Vertretern Freier Evangelischer Kirchen und Gemeinden im Raum Bonn/Rhein-Sieg-Kreis mit dem Ziel, eine Schule mit gelebten christlichen Grundwerten zu unterhalten.

In der Gründungsphase der Grundschule wurde die Schule durch den Rheinisch-Bergischen Verein getragen, bis im Herbst 2009 die Elterninitiative mit Hilfe des RBV so gestärkt war, dass sie einen eigenen Träger gründen konnte.